Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM28Q13263 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM28Q13263 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
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