Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMD2Q13200 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMD2Q13200 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms