Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALCOCO2Q13137 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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