Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPP2Q13103 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPP2Q13103 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPP2Q13103 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPP2Q13103 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms