Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKRN3Q13064 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKRN3Q13064 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKRN3Q13064 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
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