Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRDNQ13061 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRDNQ13061 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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