Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SREBF2Q12772 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SREBF2Q12772 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SREBF2Q12772 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms