Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 ICE2YIL090W 1476 nt6.76□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 SPO7YAL009W 780 nt6.75□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 AIM41YOR215C 558 nt6.75□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 AFG1YEL052W 1530 nt6.75□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 ISC1YER019W 1434 nt6.75□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 ATG4YNL223W 1485 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 COR1YBL045C 1374 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 YUR1YJL139C 1287 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 AAD15YOL165C 432 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 YBR124WYBR124W 360 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 SRP101YDR292C 1866 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 YIL055CYIL055C 1884 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 MTF2YDL044C 1323 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 SET5YHR207C 1581 nt6.74□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 GEX1YCL073C 1848 nt6.73□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 CEF1YMR213W 1773 nt6.73□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 RSC30YHR056C 2652 nt6.73□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 YBL081WYBL081W 1107 nt6.73□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 MOD5YOR274W 1287 nt6.73□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 VPS72YDR485C 2388 nt6.73□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 KKQ8YKL168C 2175 nt6.72□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 PAT1YCR077C 2391 nt6.72□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 QNS1YHR074W 2145 nt6.72□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 SKG1YKR100C 1068 nt6.72□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 CRZ1YNL027W 2037 nt6.72□□□□□ -1.33
CLF1Q12309 MRPL1YDR116C 858 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 ATG12YBR217W 561 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 TEP1YNL128W 1305 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 MRK1YDL079C 1506 nt6.71□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 RSM23YGL129C 1353 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YDL144CYDL144C 1071 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 CSL4YNL232W 879 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 UBC11YOR339C 471 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 IFA38YBR159W 1044 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 PYC2YBR218C 3543 nt6.7□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 GUP2YPL189W 1830 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YGL118CYGL118C 438 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 PHB1YGR132C 864 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 DUS4YLR405W 1104 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 CWC25YNL245C 540 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 SAC6YDR129C 1929 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YOL036WYOL036W 2286 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 EIS1YMR031C 2532 nt6.69□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 PET112YBL080C 1626 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 ATG7YHR171W 1893 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YDR278CYDR278C 318 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 MRP51YPL118W 1035 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 PET20YPL159C 762 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 RPN7YPR108W 1290 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 BPL1YDL141W 2073 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 MCM3YEL032W 2916 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 RAP1YNL216W 2484 nt6.68□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 SSK1YLR006C 2139 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YHP1YDR451C 1062 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 ICS3YJL077C 396 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 MTC2YKL098W 1074 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 LSG1YGL099W 1923 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 PUF3YLL013C 2640 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 STE13YOR219C 2796 nt6.67□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 APM4YOL062C 1476 nt6.66□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YNL247WYNL247W 2304 nt6.66□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 RPN11YFR004W 921 nt6.66□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 CNM67YNL225C 1746 nt6.66□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 KTR5YNL029C 1569 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 GEX2YKR106W 1848 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YGL072CYGL072C 360 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 SOH1YGL127C 384 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 CIS3YJL158C 684 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 YOL163WYOL163W 510 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 DAP1YPL170W 459 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 COA2YPL189C-A 207 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 RPO26YPR187W 468 nt6.65□□□□□ -1.34
CLF1Q12309 FRS2YFL022C 1512 nt6.65□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 MDH3YDL078C 1032 nt6.64□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 JJJ3YJR097W 519 nt6.64□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YBR144CYBR144C 315 nt6.64□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 DDC1YPL194W 1839 nt6.64□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 XBP1YIL101C 1944 nt6.64□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 snR78snR78 87 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 CBP4YGR174C 513 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 ERG7YHR072W 2196 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 DJP1YIR004W 1299 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 BNA5YLR231C 1362 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SNO4YMR322C 714 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 URE2YNL229C 1065 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 HSP33YOR391C 714 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 HSP32YPL280W 714 nt6.63□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 IMA5YJL216C 1746 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 AIM17YHL021C 1398 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 RRP1YDR087C 837 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 GPI11YDR302W 660 nt6.62□□□□□ -1.35
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