Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACVR1Q04771 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ACVR1Q04771 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACVR1Q04771 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms