Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP1Q00587 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP1Q00587 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms