Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5Q00535 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms