Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAE1P78406 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAE1P78406 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAE1P78406 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAE1P78406 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAE1P78406 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAE1P78406 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAE1P78406 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAE1P78406 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAE1P78406 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAE1P78406 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAE1P78406 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAE1P78406 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAE1P78406 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAE1P78406 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAE1P78406 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAE1P78406 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAE1P78406 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAE1P78406 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAE1P78406 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAE1P78406 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAE1P78406 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAE1P78406 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAE1P78406 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAE1P78406 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAE1P78406 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms