Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO1P63165 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms