Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2HP62256 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UBE2HP62256 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms