Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP1S1P61966 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP1S1P61966 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S1P61966 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.1 ms