Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOAP61586 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOAP61586 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOAP61586 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOAP61586 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOAP61586 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOAP61586 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOAP61586 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOAP61586 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOAP61586 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOAP61586 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOAP61586 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOAP61586 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOAP61586 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOAP61586 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOAP61586 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOAP61586 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOAP61586 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOAP61586 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOAP61586 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOAP61586 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOAP61586 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOAP61586 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOAP61586 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOAP61586 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOAP61586 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOAP61586 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOAP61586 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOAP61586 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOAP61586 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOAP61586 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOAP61586 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOAP61586 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOAP61586 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOAP61586 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOAP61586 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOAP61586 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOAP61586 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOAP61586 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms