Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRP55822 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRP55822 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms