Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUCLG1P53597 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SUCLG1P53597 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUCLG1P53597 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUCLG1P53597 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUCLG1P53597 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLG1P53597 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLG1P53597 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLG1P53597 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLG1P53597 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLG1P53597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLG1P53597 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLG1P53597 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLG1P53597 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms