Protein–RNA interactions for Protein: P49593

PPM1F, Protein phosphatase 1F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1FP49593 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1FP49593 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1FP49593 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1FP49593 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms