Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NESP48681 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NESP48681 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NESP48681 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NESP48681 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NESP48681 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NESP48681 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NESP48681 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NESP48681 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NESP48681 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NESP48681 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NESP48681 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NESP48681 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NESP48681 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NESP48681 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NESP48681 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
NESP48681 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
NESP48681 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NESP48681 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NESP48681 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NESP48681 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NESP48681 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
NESP48681 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NESP48681 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NESP48681 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
NESP48681 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
NESP48681 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
NESP48681 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC42■■■■■ 4.31
NESP48681 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NESP48681 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NESP48681 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NESP48681 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
NESP48681 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
NESP48681 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NESP48681 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
NESP48681 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NESP48681 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NESP48681 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NESP48681 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
NESP48681 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NESP48681 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NESP48681 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
NESP48681 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NESP48681 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NESP48681 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NESP48681 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NESP48681 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NESP48681 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NESP48681 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NESP48681 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
NESP48681 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
NESP48681 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
NESP48681 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NESP48681 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NESP48681 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
NESP48681 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
NESP48681 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
NESP48681 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NESP48681 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NESP48681 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NESP48681 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NESP48681 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
NESP48681 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NESP48681 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NESP48681 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NESP48681 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NESP48681 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NESP48681 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NESP48681 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
NESP48681 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NESP48681 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NESP48681 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NESP48681 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
NESP48681 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NESP48681 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NESP48681 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NESP48681 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NESP48681 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
NESP48681 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
NESP48681 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NESP48681 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms