Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC4P43686 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC4P43686 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms