Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC43.02■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
NCAPD3P42695 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
NCAPD3P42695 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC42.88■■■■■ 4.46
NCAPD3P42695 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCAPD3P42695 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms