Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARGP37231 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARGP37231 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPARGP37231 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARGP37231 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARGP37231 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARGP37231 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARGP37231 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPARGP37231 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGP37231 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGP37231 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGP37231 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGP37231 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGP37231 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGP37231 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGP37231 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGP37231 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGP37231 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGP37231 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGP37231 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARGP37231 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARGP37231 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGP37231 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGP37231 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGP37231 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGP37231 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGP37231 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGP37231 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGP37231 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGP37231 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGP37231 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGP37231 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGP37231 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGP37231 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGP37231 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGP37231 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGP37231 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGP37231 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGP37231 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGP37231 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGP37231 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGP37231 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGP37231 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGP37231 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGP37231 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGP37231 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGP37231 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGP37231 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARGP37231 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARGP37231 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGP37231 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGP37231 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGP37231 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGP37231 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGP37231 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGP37231 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGP37231 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGP37231 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGP37231 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGP37231 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGP37231 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGP37231 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms