Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHKAP35790 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHKAP35790 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKAP35790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKAP35790 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKAP35790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKAP35790 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKAP35790 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKAP35790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKAP35790 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKAP35790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKAP35790 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKAP35790 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKAP35790 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKAP35790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKAP35790 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKAP35790 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHKAP35790 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHKAP35790 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKAP35790 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHKAP35790 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKAP35790 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKAP35790 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKAP35790 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKAP35790 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKAP35790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHKAP35790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHKAP35790 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKAP35790 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKAP35790 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKAP35790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHKAP35790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKAP35790 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKAP35790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKAP35790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHKAP35790 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKAP35790 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKAP35790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKAP35790 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKAP35790 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHKAP35790 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHKAP35790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKAP35790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKAP35790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKAP35790 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKAP35790 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHKAP35790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKAP35790 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKAP35790 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKAP35790 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKAP35790 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKAP35790 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHKAP35790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKAP35790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKAP35790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKAP35790 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHKAP35790 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKAP35790 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKAP35790 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHKAP35790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKAP35790 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKAP35790 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKAP35790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKAP35790 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHKAP35790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms