Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A4P31645 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A4P31645 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms