Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E2P29084 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2E2P29084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E2P29084 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms