Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA4P25789 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA4P25789 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA4P25789 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms