Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA1P25786 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMA1P25786 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA1P25786 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA1P25786 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMA1P25786 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms