Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCEA1P23193 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms