Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGFR4P22455 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR4P22455 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR4P22455 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms