Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS4Y1P22090 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS4Y1P22090 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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