Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB4P21439 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB4P21439 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB4P21439 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB4P21439 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms