Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACO1P21399 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACO1P21399 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACO1P21399 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ACO1P21399 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACO1P21399 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACO1P21399 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACO1P21399 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACO1P21399 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACO1P21399 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACO1P21399 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACO1P21399 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACO1P21399 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACO1P21399 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACO1P21399 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACO1P21399 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACO1P21399 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACO1P21399 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACO1P21399 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACO1P21399 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACO1P21399 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACO1P21399 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACO1P21399 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACO1P21399 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACO1P21399 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACO1P21399 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACO1P21399 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACO1P21399 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACO1P21399 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms