Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2CP19387 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms