Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCP1P17987 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCP1P17987 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCP1P17987 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCP1P17987 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCP1P17987 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCP1P17987 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCP1P17987 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCP1P17987 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCP1P17987 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCP1P17987 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCP1P17987 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCP1P17987 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCP1P17987 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCP1P17987 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCP1P17987 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCP1P17987 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCP1P17987 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCP1P17987 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCP1P17987 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCP1P17987 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCP1P17987 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCP1P17987 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCP1P17987 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCP1P17987 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCP1P17987 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCP1P17987 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms