Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF7P17544 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF7P17544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF7P17544 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF7P17544 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF7P17544 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF7P17544 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF7P17544 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF7P17544 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF7P17544 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF7P17544 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF7P17544 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF7P17544 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF7P17544 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF7P17544 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF7P17544 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF7P17544 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF7P17544 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF7P17544 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATF7P17544 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF7P17544 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF7P17544 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF7P17544 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF7P17544 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF7P17544 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF7P17544 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF7P17544 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF7P17544 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF7P17544 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF7P17544 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF7P17544 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF7P17544 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF7P17544 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF7P17544 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF7P17544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF7P17544 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF7P17544 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF7P17544 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms