Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGA1P17096 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGA1P17096 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms