Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF44P15621 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF44P15621 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms