Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD8P13378 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD8P13378 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD8P13378 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms