Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BMP3P12645 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BMP3P12645 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BMP3P12645 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BMP3P12645 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BMP3P12645 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BMP3P12645 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BMP3P12645 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BMP3P12645 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BMP3P12645 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BMP3P12645 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BMP3P12645 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BMP3P12645 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BMP3P12645 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BMP3P12645 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BMP3P12645 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BMP3P12645 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BMP3P12645 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BMP3P12645 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BMP3P12645 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BMP3P12645 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BMP3P12645 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BMP3P12645 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BMP3P12645 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BMP3P12645 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BMP3P12645 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BMP3P12645 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BMP3P12645 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BMP3P12645 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BMP3P12645 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BMP3P12645 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BMP3P12645 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BMP3P12645 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BMP3P12645 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BMP3P12645 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BMP3P12645 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BMP3P12645 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BMP3P12645 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BMP3P12645 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BMP3P12645 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BMP3P12645 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms