Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3P05106 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITGB3P05106 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms