Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPN1P04843 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPN1P04843 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPN1P04843 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPN1P04843 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPN1P04843 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPN1P04843 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPN1P04843 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPN1P04843 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPN1P04843 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPN1P04843 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPN1P04843 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPN1P04843 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPN1P04843 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPN1P04843 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPN1P04843 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPN1P04843 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPN1P04843 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPN1P04843 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPN1P04843 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPN1P04843 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPN1P04843 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPN1P04843 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPN1P04843 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPN1P04843 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPN1P04843 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPN1P04843 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPN1P04843 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPN1P04843 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPN1P04843 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPN1P04843 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPN1P04843 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPN1P04843 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPN1P04843 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPN1P04843 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPN1P04843 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPN1P04843 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RPN1P04843 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPN1P04843 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPN1P04843 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPN1P04843 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPN1P04843 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPN1P04843 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPN1P04843 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPN1P04843 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPN1P04843 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPN1P04843 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPN1P04843 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPN1P04843 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPN1P04843 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPN1P04843 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPN1P04843 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPN1P04843 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPN1P04843 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPN1P04843 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPN1P04843 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPN1P04843 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPN1P04843 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPN1P04843 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPN1P04843 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPN1P04843 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPN1P04843 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPN1P04843 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPN1P04843 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPN1P04843 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPN1P04843 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms