Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL1BP01584 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL1BP01584 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL1BP01584 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL1BP01584 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL1BP01584 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IL1BP01584 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IL1BP01584 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IL1BP01584 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IL1BP01584 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IL1BP01584 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IL1BP01584 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IL1BP01584 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1BP01584 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1BP01584 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1BP01584 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1BP01584 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1BP01584 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL1BP01584 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL1BP01584 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IL1BP01584 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL1BP01584 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL1BP01584 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL1BP01584 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IL1BP01584 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL1BP01584 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL1BP01584 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL1BP01584 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL1BP01584 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL1BP01584 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
IL1BP01584 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1BP01584 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1BP01584 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL1BP01584 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL1BP01584 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1BP01584 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1BP01584 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1BP01584 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL1BP01584 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL1BP01584 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms