Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFNB1P01574 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNB1P01574 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNB1P01574 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNB1P01574 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms