Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APC2O95996 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APC2O95996 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APC2O95996 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APC2O95996 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APC2O95996 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APC2O95996 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APC2O95996 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APC2O95996 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APC2O95996 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APC2O95996 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APC2O95996 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APC2O95996 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APC2O95996 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APC2O95996 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APC2O95996 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APC2O95996 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APC2O95996 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APC2O95996 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APC2O95996 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APC2O95996 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APC2O95996 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APC2O95996 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APC2O95996 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APC2O95996 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APC2O95996 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APC2O95996 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APC2O95996 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APC2O95996 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APC2O95996 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APC2O95996 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APC2O95996 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APC2O95996 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APC2O95996 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APC2O95996 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APC2O95996 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APC2O95996 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APC2O95996 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APC2O95996 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APC2O95996 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APC2O95996 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APC2O95996 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APC2O95996 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APC2O95996 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APC2O95996 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APC2O95996 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APC2O95996 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APC2O95996 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APC2O95996 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APC2O95996 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APC2O95996 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APC2O95996 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APC2O95996 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APC2O95996 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APC2O95996 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APC2O95996 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APC2O95996 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APC2O95996 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APC2O95996 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APC2O95996 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APC2O95996 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APC2O95996 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APC2O95996 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APC2O95996 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APC2O95996 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms