Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL3O95236 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL3O95236 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL3O95236 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL3O95236 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL3O95236 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APOL3O95236 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
APOL3O95236 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOL3O95236 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.33■■□□□ 1
APOL3O95236 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOL3O95236 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOL3O95236 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOL3O95236 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOL3O95236 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOL3O95236 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOL3O95236 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOL3O95236 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOL3O95236 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOL3O95236 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOL3O95236 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOL3O95236 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOL3O95236 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOL3O95236 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOL3O95236 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOL3O95236 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOL3O95236 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOL3O95236 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOL3O95236 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOL3O95236 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOL3O95236 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOL3O95236 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOL3O95236 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms