Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RECQL4O94761 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RECQL4O94761 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RECQL4O94761 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms