Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPA1O75762 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPA1O75762 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPA1O75762 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPA1O75762 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPA1O75762 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRPA1O75762 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPA1O75762 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPA1O75762 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms