Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPHP4O75161 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NPHP4O75161 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPHP4O75161 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NPHP4O75161 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPHP4O75161 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms