Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KERAO60938 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KERAO60938 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KERAO60938 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KERAO60938 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KERAO60938 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KERAO60938 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KERAO60938 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KERAO60938 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KERAO60938 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms